Prolin genellikle α sarmalının sonunda veya dönüşler veya döngüler içinde bulunur. Neredeyse yalnızca polipep titlerde dönüşüm halinde bulunan diğer amino asitlerin aksine, prolin pep titlerde cis konfigürasyonunda bulunabilir.
Alfa sarmalları prolin kalıntıları içerir mi?
Artık Protein Veri Bankasında 30.000'den fazla protein yapısı olduğuna göre, prolin kalıntılarının sıklıkla önemli roller oynadıkları α-helislerinde bulunduğu açıktır. proteinin yapısında ve işlevinde.
Alfa sarmallarında hangi amino asitler var?
20 amino asitten herhangi biri bir α sarmalına katılabilir, ancak bazıları diğerlerinden daha fazla tercih edilir. Ala, Glu, Leu ve Met çoğunlukla sarmallarda bulunurken, Gly, Tyr, Ser ve Pro'nun görülme olasılığı daha düşüktür.
Beta sayfaları prolin içerir mi?
Proline, H-bağ ağını tamamlayamadığından beta levha yapılarında tercih edilmez. Yapraklarda prolin meydana geldiğinde, bir amino hidrojen bağı donörü eksikliğinin kritik olmadığı bir çıkıntı veya tabaka kenarında olabilir.
Alfa sarmalları neler içerir?
Alfa sarmalı (α sarmalı), proteinlerin ikincil yapısında ortak bir motiftir ve her omurga N−H grubu hidrojenin bulunduğu bir sağ sarmal konformasyondur. C=O omurgasına bağlanır. amino asit grubu, protein sekansı boyunca dört kalıntı daha önce yer alır.