Arabinoz, doğada yaygın olarak bulunan ve birçok bakteride tek karbon kaynağı olarak işlev görebilen beş karbonlu bir şekerdir. Enterobacteriaceae familyasının E. coli ve S. üyelerinde arabinoz bozunması için üç genden (araB, araA ve araD) protein ürünleri gereklidir.
Arabinoz bakterilere ne yapar?
Böylece arabinoz, arabinoz operonunu açmak için mevcut olduğunda, GFP üretilir ve bakteriler floresan verebilir. Arabinoz olmadan GFP geni ifade edilmez ve floresan olmaz. Bu nedenle, bir araştırmacı, besin bileşimini değiştirerek, dönüştürülmüş bakterilerde floresansın ne zaman (ve olup olmayacağını) kontrol edebilir.
Bakteriyel transformasyonda arabinozun rolü nedir?
Arabinose, AraC'nin allosterik düzenleyicisi olarak hareket eder, hangi DNA bölgelerine bağlandığını ve nasıl bir dimer oluşturduğunu değiştirir. Arabinozun, AraBAD operonunun proteinleri tarafından katabolize edilen şeker olduğunu unutmayın. E. coli'nin yaşadığı ortama arabinoz eklendiğinde, AraC'ye sıkıca bağlanır.
Arabinoz neden kullanılır?
Biyolojide kullanım
Sentetik biyolojide, arabinoz genellikle Pbad altında protein ifadesi için tek yönlü veya geri dönüşümlü bir anahtar olarak kullanılır. E. coli'de promotör. Bu on-switch, glikoz varlığı ile olumsuzlanabilir veya katabolit baskısının bir şekli olan kültür ortamına glikoz eklenmesiyle tersine çevrilebilir.
Nasılarabinoz bakterilerde gen regülasyonunu ve ekspresyonunu etkiler mi?
Arabinoz mevcut olduğunda, araC DNA konfigürasyonunu gevşetir, böylece transkripsiyon meydana gelebilir, ancak bu karbonhidrat olmadığında, aynı protein DNA'yı bağlanma yeteneğini az altmak için kısıtlar. RNA polimeraz ile.
